Harald,
was meinst Du mit “ausschalten“?
Der Mega/Due hängt immer an der Batterie und kann in der Standard-Umsetzung nur mittels Hardwareschalter durch Trennen der Batteriespannung ganz stromlos geschaltet werden.
Aus meiner Sicht gibt es keine (Standard-) Lösung, vollständig per Software abzuschalten. Die Frage wäre dann, wie, wann, warum schaltet man wieder ein.
Vielleicht erklärst Du mal den Hintergrund Deiner Frage.
Gruß Fürst Ruprecht